不仅仅是燃气锅炉，无论是什么类型的机械在操作的过程中都需要注意很多问题的，因为随着时间的推移，产品的零部件也都慢慢腐化，所以无论什么时期的锅炉在运行中要注意以下问题：
1　建立经济运行管理制度：燃气锅炉的使用单位应建立相应的锅炉经济运行管理制度。
2　锅炉节水节能：锅炉给水泵宜采用变速装置。锅炉连续排污水的热量应当合理利用，根据锅炉房连续排污总量设置连续排污膨胀器。锅炉的风机轴承、水泵轴承的冷却水应当尽可能循环使用。
燃气锅炉及其系统应当杜绝跑、滴、冒、漏，充分利用冷凝水、二次蒸汽和连续排污水的热量，并且采取措施尽可能提高可回收冷凝水的回收利用率。
3　运行负荷：该系列燃气锅炉在80%～100%负荷下可正常运行，所采用然气低位发热值≥35438KJ/　NM3，城市煤气低位发热值≥16750KJ/　NM3、轻柴油热值≥42917　KJ/Kg。燃气锅炉运行时，应选用设计燃料或设计燃料相近的燃料。
4　锅炉房系统合理布置：锅炉房布置应当在保证安全性能的前提下，充分提高能源利用效率，减少电、水、自用热以及其他消耗，促进热能回收和梯级利用。锅炉房设备布置时应当尽量减少管道、烟风道的长度及其弯头数量，以减少流动阻力。